Люминесцентную микроскопию можно использовать для окраски микроорганизмов: в мазках; во взвеси; при их росте на питательной среде; в тканевых срезах; в теле инфицированного животного путем введения флуорохрома в вену.
Определение патогенного вида микроба в материале больного путем обработки специфическими иммунными флуорохромированными сыворотками.
Большую и своеобразную роль играют люминесцентно-микроскопические исследования строения микроорганизмов. Первые прижизненные люминесцентно-микроскопические исследования строения микробной клетки осуществили С. Штруггер. М. К. Мейссель со своими сотрудниками. А. Крит. На представителях разных видов микробов показано наличие ядерных структур, цитоплазмы, жировых и липоидных включений. Использовано различное отношение акридинового оранжевого для цитохимической идентификации ДНК и РНК при люминесцентно-микроскопическом исследовании особенностей нуклеиновых кислот вирусов в процессе их размножения (Дж. Армстронг и Дж. Ннвен). При помощи люминесцентно-меченных антител дан анализ распределения антигенов в бактериальной клетке, что создало новые возможности для исследования цитохимической структуры микробной клетки люминесцентно-серологическим методом (Б. Томасон и сотрудники). Ниже описана методика приготовления препаратов из некоторых культур для люминесцентной микроскопии.
Флуорохромирование дифтерийной палочки корифосфином НК: 1. Фиксация мазка в течение 20 секунд в метиловом спирте. 2. Промывание. 3. Обработка в течение десяти минут в смеси: водного раствора корифосфина НК 1 : 1000-5 мл, уксусной кислоты – 10 мл, дистиллированной воды – 85 мл. 4. Промывание. 5. Подсушивание.
Патогенные микроорганизмы в естественных условиях живут, развиваются и действуют в ассоциации с другими патогенными и сапрофитными бактериями. Одним из способов диагностики инфекционного заболевания является выделение чистой культуры и идентификация ее, определение вида, подвида, разновидности, типа.