На средах с добавлением крови морфология колоний может не иметь кружевной формы; с добавлением сульфита натрия или манифестатор а Покровской вырастают типичные для чумного микроба колонии. Из материала, загрязненного посторонней гнилостной микрофлорой, выделить чумного микроба сложно, потому что он подавляется ростом посторонней флоры, в частности вульгарного протея. В таком случае к питательной среде добавляют спиртовый раствор генцианвиолета (в разведении 1 : 100 000) или генцианвиолет с химически чистым сульфитом натрия (элективная среда). В. М. Туманский пользуется элективно-чувствительной средой, в которой имеет значение кровь или антифаговая сыворотка с генцианвиолетом. На таких средах повышается способность роста чумного микроба, пораженного бактериофагом.
Биологическая проба является обязательной при диагностике чумы у больных. С этой целью используют лабораторных животных, обладающих высокой инфекционной чувствительностью к чумному микробу, а именно, морских свинок или белых мышей. Частью подозрительного материала заражают морских свинок. Заражение проводят подкожно, однако в зависимости от материала могут быть использованы и другие методики заражения (внутрибрюшинное, втирание в кожу, которое является наиболее простым и поэтому имеет преимущества перед другими методами). Материал впрыскивают под кожу внутренней поверхности бедра или нижней части живота. При достаточном количестве возбудителя в материале морские свинки гибнут большей частью на четвертый-шестой день.
Из места вспрыскивания, из тканей вокруг этого места или из желез делают мазки для микроскопии, посевы для выделения культуры. На вскрытии отмечаются увеличение и геморрагическое перерождение регионарных желез, некротические узлы в селезенке, перерождение паренхиматозных органов.
Учет результатов начинается через 3-3 Viчаса. Часто для выявления чумного микроба требуется всего пять-шесть часов. Чумной микроб удается обнаруживать и при наличии посторонней микрофлоры, которая заметно не снижает титра чумного бактериофага.